Впервые за 79 лет в храме состоялось богослужение, которое возглавил епископ Череповецкий и Белозерский Флавиан.

Епископу Флавиану сослужили клирики Белозерского и Череповецкого благочиний. После Божественной литургии владыка совершил славление и обратился к верующим с архипастырской проповедью, поздравив всех с праздником и важным историческим событием в жизни Белозерска.

Владыка поблагодарил директора Белозерского областного краеведческого музея Залогину Татьяну Валерьевну, а в ее лице и всех работников музея, за труды по сохранению собора.

Богослужения в соборе совершались до августа 1937 года: в период Большого террора 1937—1938 годов все священники Белозерска, включая соборного протоиерея Сергия Белицкого, были арестованы и 9 октября 1937 года расстреляны в Ленинграде. После закрытия собора его внутреннее убранство сохранялось и поддерживалось. В 2012 году работники музея провели ремонтно-восстановительные работы иконостаса, храма и прилегающей территории.

В настоящее время храм передан Череповецкой епархии.