Пятнадцать лет прожил Филипп в обители преподобного Корнилия.
Трудолюбивый и смиренный иеромонах заслужил уважение и любовь братии, однако внимание к себе мешало ему в духовной жизни.
Он отправился искать место для безмолвной жизни. На берегу реки Андоги, недалеко от ручья Ирапы (это территория нынешнего Кадуйского района) монах поставил часовню во имя Святой Троицы и келию.
Молва о пустыннике быстро распространилась по всей округе. К отшельнику стали приходить люди, желавшие иноческой жизни. На месте часовни была построена Троицкая церковь.
Пятнадцать лет подвизался святой в пустыни. Он отошел к Господу 27 ноября 1527 года в возрасте сорока пяти лет. Вскоре на месте подвигов преподобного Филиппа появилась обитель, которая просуществовала до 1927 года. Мощи святого долгие годы были под спудом. В ноябре 2000 года они были обретены и перенесены в часовню в центре Череповца.
Память святого совершается 27 ноября.
Снедавних пор в обители преподобного Филиппа Ирапского возрождается монашеская жизнь. Свято-Троицкая Филиппо-Ирапская пустынь расположена в 20 километрах от железнодорожной станции Кадуй на правом берегу реки Андоги, в местности, которая издревле называлась Красный Бор. Здесь Андога образует крутую излучину, и вид с ее берега открывается очень живописный. Кроме Андоги, пустынь омывается двумя ручьями: Малым Ирапом с запада и Большим Ирапом с востока.
Одним из последних игуменов монастыря был Леонид (Молчанов), злодейски убитый в 1918 году в Сольвычегодске, куда его перевели незадолго до мученической кончины.
В 2005 году преподобномученик Леонид был причислен к Собору новомучеников и исповедников Церкви Русской.
В день столетия мученической кончины святого Леонида, 13 ноября, в Филиппо-Ирапской пустыни была совершена Божественная литургия, за которой молились братия обители и паломники.