Храм был закрыт в 30-х годах ХХ столетия и использовался не по назначению: в последнее время в нем размещался склад автозапчастей, ремонтные боксы, а в алтаре - диспетчерская Кирилловского пассажирского автотранспортного предприятия.

В конце 2014 года в Кириллове был образован православный приход храма Вознесения Господня. Хотя город и небольшой, и в нем находится Кирилло-Белозерский монастырь и два действующих храма, но кирилловчане с усердием занялись возрождением церкви. За год храм был подготовлен к совершению Божественной литургии.

По благословению Высокопреосвященнейшего Игнатия, митрополита Вологодского и Кирилловского, первая Литургия была совершена 12 августа, в день памяти святого мученика Иоанна Воина. Один из приделов храма освящен в честь этого святого, и старожилы до сих пор называют эту церковь храмом Иоанна Воина.

Первую со времени закрытия храма Литургию с крестным ходом совершил благочинный Кирилловского округа и настоятель протоиерей Владимир Колосов. На престольном празднике молилась 100-летняя прихожанка Любовь Васильевна Серавина, которая помнит храм еще до его закрытия.

Литургия в Вознесенском храме будет совершаться ежемесячно в теплое время года.